MR mišićno-skeletnog sistema (koljena, lakata, ramena, stopala, mali zglobova) koristi se za prikaz mišića, tetiva, ligamenata, hrskavice, meniskusa i labruma, zglobne čahure ali i za prikaz kostiju. Osim traumatskih oštećenja, MR-om otkrivamo upalne i degenrativne promjene, razvojne anomalije te tumore mišićno-skeletnog sustava.

Pregled se obavlja u specijalnoj MR sali, gde pacijent leži na stolu oko koga se nalazi magnetni kalem. Sistem je poluotvoren, sa tunelom dužine od 160 cm, tako da nema opasnosti od osećaja klaustrofobije, kao kod uređaja prethodnih generacija. Za pregled nije potrebna nikakva posebna priprema, niti davanja lijekova (premedikacija). Samo u specijalnim slučajevima se vrši ubrizgavanje kontrastnog sredstva, što propisuje ljekar za vrijeme pregleda.

Pregled je apsolutno bezbolan. Neophodno je da se ne pomjerate za vreme pregleda. Zahvaljujući izuzetnoj snazi aparata (1,5 Tesla) za većinu pregleda je dovoljno svega petnaestak minuta, a jedinu neprijatnost može predstavljati buka koja potiče od promjena gradijenata magnetnog polja. Za vreme pregleda vam je omogućena komunikacija sa tehničarem, a u slučaju neprijatnosti bilo koje vrste ispitivanje se može prekinuti u svakom trenutku.

Metalni predmeti unjeti nepažnjom u zonu dejstva magnetnog polja mogu nanjeti štetu Vama i osoblju, pa zbog toga u MR salu ne smijete unjeti sledeće: Naočare, aparat za sluh, metalne predmete sa odjela (šnale, broševe, kaiševe i sl.) šnale za kosu i perike, zubne proteze, sitne metalne predmete iz džepova (ključeve, olovke, novac i sl.), satove, mobilne telefone, platne kartice, nakit.